Superczułe markery zbadają ważne enzymy

Dr hab. Marcin Drąg (laureat programów START oraz FOCUS) wraz ze swoimi doktorantami (mgr inż. Pauliną Kasperkiewicz i mgr. inż. Marcinem Porębą) opracowali nowatorską technologię badania enzymów proteolitycznych, nazwaną HyCoSuL (ang. Hybrid Combinatorial Substrate Library). Wyniki ich badań, prowadzonych w ramach subsydium FOCUS, zostały opublikowane w prestiżowym czasopiśmie PNAS („The Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America”).

Enzymy proteolityczne (proteazy, peptydazy) odgrywają bardzo ważną rolę w funkcjonowaniu zarówno pojedynczej komórki, jak i całego organizmu. Już od dawna wiadomo, że zachwianie ich działania prowadzi do powstania w organizmie stanów patofizjologicznych, czego następstwem są np. choroby cywilizacyjne takie jak nowotwory, cukrzyca, nadciśnienie czy infekcje wirusowe i bakteryjne. Biorąc to pod uwagę, proteazy są bardzo atrakcyjnym „poligonem doświadczalnym” w kontekście projektowania nowych, bardziej czułych i specyficznych markerów do badania ich aktywności w złożonych układach biologicznych. Jednak droga do znalezienia takiej cząsteczki chemicznej jest czasami bardzo długa.

– Zanim opracujemy efektywny marker do badania tylko jednego, konkretnego enzymu, najpierw musimy poznać jego preferencje katalityczne – tzw. specyficzność substratową – tłumaczy kierownik projektu dr hab. Marcin Drąg. – Istniejące do tej pory narzędzia kompleksowego profilowania enzymów proteolitycznych opierały się na zastosowaniu jedynie naturalnych aminokwasów występujących w białkach. Unikalny charakter naszych badań polega na wykorzystaniu bardzo szerokiej gamy nienaturalnych aminokwasów (niekodowanych w DNA, będących w większości produktami syntezy organicznej) do konstrukcji hybrydowej (zawierającej naturalne i nienaturalne aminokwasy) biblioteki substratów fluorogenicznych (HyCoSuL). Dzięki temu narzędziu jesteśmy w stanie stworzyć nowe, bardziej czułe substraty i markery chemiczne dla bardzo dużej grupy enzymów proteolitycznych.

Źródło: FNP

Więcej: http://www.fnp.org.pl/superczule-markery-pomoga-zbadac-wazne-medycznie-enzymy/